MTs. Falahul Huda merupakan lembaga pendidikan tingkat menengah pertama yang memadukan kurikulum Kementrian Agama dengan Kementrian Dinas Pendidikan. Lembaga ini berlokasi di Dusun Majasem RT. 002 RW. 001 Desa Mojoagung Kecamatan Plantungan Kabupaten Kendal.

Berawal dari keprihatinan melihat minat anak-anak di Desa Mojoagung yang ingin melanjutkan pendidikan dari tingat sekolah dasar ke jenjang berikutnya begitu antusias. Namun terkendala dengan jarak antara Desa Mojoagung menuju SMP ataupun MTs terdekat yaitu sekitar 5 sampai 7 kilometer dan tidak tersedianya sarana transportasi yang bisa diandalkan.

Bagi sebagian siswa yang orang tuanya berada, memfasilitasi anak-anaknya dengan sepeda motor untuk berangkat dan pulang sekolah, sebaliknya bagi orang tua yang kurang mampu secara finansial, mereka menyuruh anak-anaknya untuk ikut transportasi mobil yang disewa oleh sekolah karena tidak tersedianya transportasi umum. Ironisnya dikala mobil sekolah itu rusak maka kebanyakan dari siswa yang orang tuanya kurang mampu tersebut harus memupuskan niatnya untuk pergi ke sekolahnya dan hal tersebut terjadi tidak hanya sekali namun berulang kali.

Oleh sebab itulah, beberapa orang di Desa Mojoagung yang notabennya adalah guru berkecimpung dalam dunia pendidikan merasa tergerak hatinya untuk segera mendirikan sebuah yayasan yang bernama Yayasan Falahul Huda yang didukung oleh masyarakat sekitar sebagai wadah atau payung hukum untuk mendirikan sebuah lembaga pendidikan tingkat menengah pertama yang diberi nama Madrasah Tsanawiyah (MTs) Falahul Huda.

MTs. Falahul Huda mulai beroperasi pada awal tahun pelajaran 2011/2012 dengan jumlah 27 siswa dan resmi mendapatkan ijin operasional pada tanggal 11 Oktober 2011 dari kator Kementerian Agama Kabupaten Kendal.